關于產量

三代測序儀以其超長讀長的優(yōu)勢，在基因組學中備受青睞。Nanopore平臺借助單個分子通過納米孔時引起孔兩側電位差來實現信號檢測，從而實現測序。因Nanopore測序讀長更長且通量高的特點，近幾年在基因組組裝應用中嶄露頭角。

百邁客全新R9芯片單cell數據量由之前的97Gb提升至178 Gb，產量提升近2倍。R10芯片單cell數據量也達到了80 Gb。更長的讀長，更高的產量將使得高重復大基因組更易被解析。

表1 同一樣品不同芯片對比產出情況（Denovo 30Kb 文庫）

表2 不同樣品及試劑盒產出情況統(tǒng)計

關于質量值

本次更新不僅是有了量的突破，同時也有了質的飛躍，Oxford Nanopore近期發(fā)布了一款名為Bonito CRF的新算法，基于大數據進行準確度訓練，可有效提高對單條讀長序列識別（在DNA單分子上確定堿基序列過程）的準確性。通過與最常用的basecalling軟件比對可以發(fā)現，Bonito可以有效提升序列識別的準確性，使得高準確性基因組組裝成為可能。

表3 新舊Basecalling軟件對同一數據識別準確性比對

為了比較兩種新版本測序芯片準確性情況，百邁客研究團隊對新版本R9與R10芯片進行basecalling，結果不難發(fā)現同一芯片下，Bonito比Guppy提升了~9%，而R10準確性已突破90%。

表4 新R9.4.1及R10 basecalling結果比對

圖1 同一樣本R9.4.1 vs R10 原始產出質量值對比

Bonito下R10準確率數據統(tǒng)計，容小編在這里小小的賣個關子，下次揭曉謎底~ 可以預見的是，R10結合Bonito將在更廣泛的基因組范圍內獲得一致的高精度結果！后續(xù)小編將會系統(tǒng)的展示高質量下基因組的組裝結果及情況，后續(xù)更多數據及結果敬請期待！
百邁客作為ONT全球戰(zhàn)略合作伙伴，將繼續(xù)為所有的科研工作者提供更長更準的測序及分析服務。

百邁客與ONT戰(zhàn)略合作簽約合影

（右下：百邁客CEO鄭洪坤先生；左下：牛津納米孔CEO Gordan Sanghera博士）

百邁客自2018年8月與牛津納米孔公司達成長期合作，擁有MinION、GridION X5和PromethION三種型號全套納米孔測序儀。更是中國大陸全部通過PromthION/GridION平臺及DNA/RNA產品官方認證的公司。