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 分類: 微生物組測(cè)序

在微生物研究領(lǐng)域,細(xì)菌基因組的組裝與分析效率,往往直接決定了科研項(xiàng)目的推進(jìn)速度。無(wú)論是臨床病原菌溯源、農(nóng)業(yè)益生菌功能解析,還是環(huán)境微生物群落研究,研究者們都在期待更高效、更靈活、更可靠的技術(shù)方案。

現(xiàn)在,百邁客生物細(xì)菌基因組產(chǎn)品帶著五大核心升級(jí)重磅來(lái)襲,從樣本起始量到分析周期,從組裝方式到數(shù)據(jù)應(yīng)用,全方位打破行業(yè)瓶頸,為你的科研加速!

升級(jí) 1:低建庫(kù)起始量,珍貴樣本不再 “難倒英雄漢”

??很多時(shí)候,科研中的細(xì)菌樣本來(lái)之不易 —— 可能是臨床分離的少量病原菌,也可能是環(huán)境中富集的稀缺菌株,樣本量不足往往讓后續(xù)實(shí)驗(yàn) “卡殼”。此次百邁客生物 產(chǎn)品針對(duì)性優(yōu)化建庫(kù)技術(shù):

  • ONT 平臺(tái):建庫(kù)起始量低至 500ng / 次,無(wú)需大量擴(kuò)增即可啟動(dòng)實(shí)驗(yàn);
  • PB 平臺(tái):建庫(kù)起始量低至 250ng / 次,珍貴樣本也能輕松滿足實(shí)驗(yàn)需求。

再也不用為 “樣本少” 發(fā)愁,讓每一份寶貴樣本都能發(fā)揮最大研究?jī)r(jià)值!?

升級(jí) 2:純?nèi)M裝,擺脫二代數(shù)據(jù)依賴,分析流程直接 “拎包即用”

傳統(tǒng)細(xì)菌基因組組裝常需依賴二代數(shù)據(jù)校正,不僅增加了實(shí)驗(yàn)成本,還延長(zhǎng)了分析周期,流程銜接中也容易出現(xiàn)問(wèn)題。

百邁客生物此次實(shí)現(xiàn)僅三代組裝技術(shù)突破:無(wú)需搭配二代數(shù)據(jù),僅憑三代長(zhǎng)讀長(zhǎng)優(yōu)勢(shì),就能完成高質(zhì)量基因組組裝。更重要的是,我們已搭建好完備的純?nèi)治隽鞒蹋瑥臄?shù)據(jù)下機(jī)到組裝結(jié)果輸出,全程標(biāo)準(zhǔn)化、自動(dòng)化,無(wú)需你額外調(diào)試,拿到樣本即可啟動(dòng)分析,大幅減少流程搭建的時(shí)間成本。

升級(jí) 3:極速周期低至 15 天,科研進(jìn)度 “快人一步”

科研競(jìng)爭(zhēng)講究 “時(shí)間就是成果”,漫長(zhǎng)的分析周期往往會(huì)錯(cuò)過(guò)最佳研究窗口。

百邁客生物通過(guò)技術(shù)優(yōu)化與流程重構(gòu),將細(xì)菌基因組項(xiàng)目的整體周期壓縮至低至 15 天—— 從樣本接收、建庫(kù)測(cè)序,到組裝分析、結(jié)果交付,全程高效推進(jìn),讓你更快拿到核心數(shù)據(jù),加速論文撰寫與項(xiàng)目結(jié)題。

升級(jí) 4:成功率≥98%,超高成功率,實(shí)驗(yàn)放心 “不翻車”

“樣本做廢了”“數(shù)據(jù)沒(méi)出來(lái)”,是科研中最讓人崩潰的情況。百邁客生物深知實(shí)驗(yàn)可靠性的重要性,通過(guò)優(yōu)化樣本提取、建庫(kù)緩沖體系等關(guān)鍵環(huán)節(jié),將細(xì)菌基因組項(xiàng)目的整體成功率提升至≥95% ,顯著高于行業(yè)平均提取與實(shí)驗(yàn)成功率。

無(wú)論是復(fù)雜細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)的細(xì)菌,還是低豐度樣本,我們都能最大限度保障實(shí)驗(yàn)成功,讓你的科研每一步都更穩(wěn)妥。

升級(jí) 5:個(gè)性化上云功能,數(shù)據(jù)挖掘 “更懂你”

誰(shuí)說(shuō)數(shù)據(jù)分析不能又快又聰明?百邁客生物獨(dú)家提供個(gè)性化云上服務(wù),秒殺絕大多數(shù)同行!涵蓋六大功能,總有一款適合您:

百邁客生物打破這一局限,推出行業(yè)稀缺的個(gè)性化上云服務(wù),五大核心功能直擊研究痛點(diǎn),讓數(shù)據(jù)挖掘更高效、更精準(zhǔn)。

百邁客生物會(huì)將您的項(xiàng)目報(bào)告推送到您的云賬號(hào)下,在項(xiàng)目下可以直接進(jìn)行個(gè)性化分析,無(wú)需再整理復(fù)雜的文件表格進(jìn)行輸入,無(wú)生物學(xué)基礎(chǔ)亦可輕松拿捏基因組個(gè)性化分析。

1、通用數(shù)據(jù)庫(kù)注釋篩選

基于云平臺(tái),你可根據(jù) “毒力基因”“耐藥基因”“代謝通路” 等研究關(guān)鍵詞,一鍵篩選目標(biāo)注釋結(jié)果,無(wú)需在海量數(shù)據(jù)中手動(dòng)查找;

打分參數(shù)、可靠性參數(shù)設(shè)置,均可隨性設(shè)置。

2、基因組圖譜查詢

云平臺(tái)內(nèi)置【基因組圖譜展示工具】,點(diǎn)擊即可查看基因組環(huán)形圖、基因位置分布等信息,直觀掌握基因組結(jié)構(gòu)(示意圖如下)

3、T3SS分泌系統(tǒng)預(yù)測(cè)

基于EffectiveT3精準(zhǔn)預(yù)測(cè)III型分泌蛋白,致病機(jī)制研究更深入!

4、GTDB-tk分類鑒定

輸入細(xì)菌基因組序列,即可通過(guò)該工具完成物種分類,明確菌株進(jìn)化地位

5、ANI分析

快速計(jì)算基因組間相似性,可選多參考基因組比對(duì),并生成熱圖,物種界定更輕松!

6、SNP進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建

物種進(jìn)化樹(shù)(?稱系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)或?命樹(shù))是?物學(xué)中?來(lái)描述不同物種或?物類群之間演化關(guān)系的樹(shù)狀圖。它通過(guò)分?結(jié)構(gòu)展示物種的分化過(guò)程、共同祖先及親緣關(guān)系的遠(yuǎn)近。使?snippy軟件進(jìn)?core snp 分析,基于樣本間的core snp ,使?phmyl構(gòu)建進(jìn)化樹(shù),展示?標(biāo)物種與給定的菌株之前的近緣關(guān)系。

用 snippy 篩選核心 SNP,結(jié)合 phmyl 構(gòu)建進(jìn)化樹(shù),清晰展示目標(biāo)菌株與參考菌株的親緣關(guān)系,助力溯源與進(jìn)化分析。

從 “能做” 到 “做好”,從 “出數(shù)據(jù)” 到 “出成果”,百邁客生物細(xì)菌基因組產(chǎn)品始終以研究者需求為核心,不斷迭代升級(jí)。此次五大升級(jí)已全面落地,后續(xù)還將推出更多貼合科研場(chǎng)景的功能,為你的細(xì)菌研究提供更強(qiáng)大的技術(shù)支撐!


  • 細(xì)菌基因組研究正不斷突破,百邁客生物還將持續(xù)推出更多升級(jí)服務(wù)!敬請(qǐng)期待!
  • 無(wú)論是病原微生物研究、環(huán)境微生物組分析,還是功能基因挖掘,百邁客生物助您穩(wěn)扎穩(wěn)打、快人一步!
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